Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms