Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt16Q9Z2K1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms