Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms