Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms