Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F4

Cib1, Calcium and integrin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib1Q9Z0F4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cib1Q9Z0F4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms