Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ5

Apip, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApipQ9WVQ5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ApipQ9WVQ5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApipQ9WVQ5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApipQ9WVQ5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApipQ9WVQ5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApipQ9WVQ5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApipQ9WVQ5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApipQ9WVQ5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ApipQ9WVQ5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApipQ9WVQ5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ApipQ9WVQ5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApipQ9WVQ5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ApipQ9WVQ5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApipQ9WVQ5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApipQ9WVQ5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApipQ9WVQ5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApipQ9WVQ5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApipQ9WVQ5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApipQ9WVQ5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApipQ9WVQ5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApipQ9WVQ5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApipQ9WVQ5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ApipQ9WVQ5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ApipQ9WVQ5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ApipQ9WVQ5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ApipQ9WVQ5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ApipQ9WVQ5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ApipQ9WVQ5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ApipQ9WVQ5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ApipQ9WVQ5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ApipQ9WVQ5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ApipQ9WVQ5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ApipQ9WVQ5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ApipQ9WVQ5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ApipQ9WVQ5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ApipQ9WVQ5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ApipQ9WVQ5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ApipQ9WVQ5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ApipQ9WVQ5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ApipQ9WVQ5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms