Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms