Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms