Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms