Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms