Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Vax2Q9WTP9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Vax2Q9WTP9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Vax2Q9WTP9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Vax2Q9WTP9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Vax2Q9WTP9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Vax2Q9WTP9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Vax2Q9WTP9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Vax2Q9WTP9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Vax2Q9WTP9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vax2Q9WTP9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vax2Q9WTP9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vax2Q9WTP9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Vax2Q9WTP9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vax2Q9WTP9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vax2Q9WTP9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vax2Q9WTP9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vax2Q9WTP9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vax2Q9WTP9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vax2Q9WTP9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vax2Q9WTP9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vax2Q9WTP9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vax2Q9WTP9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vax2Q9WTP9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vax2Q9WTP9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vax2Q9WTP9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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