Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms