Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms