Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M3

Srpx, Sushi-repeat-containing protein SRPX, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpxQ9R0M3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms