Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms