Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vav3Q9R0C8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms