Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Znf346Q9R0B7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms