Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms