Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms