Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

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Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Col4a4Q9QZR9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a4Q9QZR9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a4Q9QZR9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a4Q9QZR9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a4Q9QZR9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a4Q9QZR9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a4Q9QZR9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a4Q9QZR9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a4Q9QZR9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a4Q9QZR9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a4Q9QZR9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a4Q9QZR9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a4Q9QZR9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a4Q9QZR9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a4Q9QZR9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a4Q9QZR9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a4Q9QZR9 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a4Q9QZR9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a4Q9QZR9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a4Q9QZR9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a4Q9QZR9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a4Q9QZR9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col4a4Q9QZR9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col4a4Q9QZR9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col4a4Q9QZR9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col4a4Q9QZR9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col4a4Q9QZR9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col4a4Q9QZR9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col4a4Q9QZR9 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col4a4Q9QZR9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col4a4Q9QZR9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col4a4Q9QZR9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col4a4Q9QZR9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col4a4Q9QZR9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col4a4Q9QZR9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col4a4Q9QZR9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col4a4Q9QZR9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col4a4Q9QZR9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col4a4Q9QZR9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col4a4Q9QZR9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a4Q9QZR9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a4Q9QZR9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Col4a4Q9QZR9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a4Q9QZR9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a4Q9QZR9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a4Q9QZR9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Col4a4Q9QZR9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Col4a4Q9QZR9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a4Q9QZR9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a4Q9QZR9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a4Q9QZR9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a4Q9QZR9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a4Q9QZR9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a4Q9QZR9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a4Q9QZR9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a4Q9QZR9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a4Q9QZR9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a4Q9QZR9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a4Q9QZR9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a4Q9QZR9 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a4Q9QZR9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a4Q9QZR9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a4Q9QZR9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a4Q9QZR9 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a4Q9QZR9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a4Q9QZR9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a4Q9QZR9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a4Q9QZR9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a4Q9QZR9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a4Q9QZR9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a4Q9QZR9 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a4Q9QZR9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a4Q9QZR9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a4Q9QZR9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a4Q9QZR9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a4Q9QZR9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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