Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms