Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rad18Q9QXK2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad18Q9QXK2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad18Q9QXK2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad18Q9QXK2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad18Q9QXK2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad18Q9QXK2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad18Q9QXK2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad18Q9QXK2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad18Q9QXK2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad18Q9QXK2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad18Q9QXK2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad18Q9QXK2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad18Q9QXK2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad18Q9QXK2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad18Q9QXK2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad18Q9QXK2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad18Q9QXK2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad18Q9QXK2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad18Q9QXK2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad18Q9QXK2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad18Q9QXK2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad18Q9QXK2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad18Q9QXK2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad18Q9QXK2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad18Q9QXK2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad18Q9QXK2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad18Q9QXK2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad18Q9QXK2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad18Q9QXK2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad18Q9QXK2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad18Q9QXK2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad18Q9QXK2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad18Q9QXK2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad18Q9QXK2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad18Q9QXK2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad18Q9QXK2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad18Q9QXK2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms