Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms