Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms