Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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