Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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