Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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CtsmQ9JL96 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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CtsmQ9JL96 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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CtsmQ9JL96 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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CtsmQ9JL96 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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CtsmQ9JL96 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtsmQ9JL96 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms