Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pole3Q9JKP7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pole3Q9JKP7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pole3Q9JKP7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pole3Q9JKP7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pole3Q9JKP7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pole3Q9JKP7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pole3Q9JKP7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pole3Q9JKP7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pole3Q9JKP7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pole3Q9JKP7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pole3Q9JKP7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pole3Q9JKP7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pole3Q9JKP7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pole3Q9JKP7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pole3Q9JKP7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pole3Q9JKP7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pole3Q9JKP7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pole3Q9JKP7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pole3Q9JKP7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pole3Q9JKP7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pole3Q9JKP7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pole3Q9JKP7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pole3Q9JKP7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pole3Q9JKP7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pole3Q9JKP7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pole3Q9JKP7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pole3Q9JKP7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pole3Q9JKP7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pole3Q9JKP7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms