Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms