Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trem1Q9JKE2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms