Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms