Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Tuba8Q9JJZ2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
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Tuba8Q9JJZ2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Tuba8Q9JJZ2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Tuba8Q9JJZ2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Tuba8Q9JJZ2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
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Tuba8Q9JJZ2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms