Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIA1

Lgi1, Leucine-rich glioma-inactivated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgi1Q9JIA1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms