Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cldn19Q9ET38 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn19Q9ET38 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Cldn19Q9ET38 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Cldn19Q9ET38 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Cldn19Q9ET38 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Cldn19Q9ET38 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms