Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
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Rb1cc1Q9ESK9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
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Rb1cc1Q9ESK9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
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Rb1cc1Q9ESK9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
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Rb1cc1Q9ESK9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
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Rb1cc1Q9ESK9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
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Rb1cc1Q9ESK9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
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Rb1cc1Q9ESK9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rb1cc1Q9ESK9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rb1cc1Q9ESK9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rb1cc1Q9ESK9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rb1cc1Q9ESK9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rb1cc1Q9ESK9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rb1cc1Q9ESK9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rb1cc1Q9ESK9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Rb1cc1Q9ESK9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rb1cc1Q9ESK9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rb1cc1Q9ESK9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rb1cc1Q9ESK9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rb1cc1Q9ESK9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rb1cc1Q9ESK9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rb1cc1Q9ESK9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rb1cc1Q9ESK9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rb1cc1Q9ESK9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Rb1cc1Q9ESK9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rb1cc1Q9ESK9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
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