Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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