Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms