Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERT2

Trhr2, Thyrotropin-releasing hormone receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trhr2Q9ERT2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trhr2Q9ERT2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trhr2Q9ERT2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trhr2Q9ERT2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trhr2Q9ERT2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trhr2Q9ERT2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trhr2Q9ERT2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trhr2Q9ERT2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trhr2Q9ERT2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trhr2Q9ERT2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trhr2Q9ERT2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trhr2Q9ERT2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trhr2Q9ERT2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trhr2Q9ERT2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Trhr2Q9ERT2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Trhr2Q9ERT2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Trhr2Q9ERT2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Trhr2Q9ERT2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trhr2Q9ERT2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trhr2Q9ERT2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trhr2Q9ERT2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trhr2Q9ERT2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trhr2Q9ERT2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trhr2Q9ERT2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms