Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 328.6 ms