Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms