Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ41

Vmn1r29, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r29Q9EQ41 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r29Q9EQ41 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms