Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms