Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms