Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms