Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aph1cQ9DCZ9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aph1cQ9DCZ9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Aph1cQ9DCZ9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aph1cQ9DCZ9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aph1cQ9DCZ9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aph1cQ9DCZ9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aph1cQ9DCZ9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aph1cQ9DCZ9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aph1cQ9DCZ9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aph1cQ9DCZ9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aph1cQ9DCZ9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aph1cQ9DCZ9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aph1cQ9DCZ9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aph1cQ9DCZ9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aph1cQ9DCZ9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aph1cQ9DCZ9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aph1cQ9DCZ9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aph1cQ9DCZ9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aph1cQ9DCZ9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aph1cQ9DCZ9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aph1cQ9DCZ9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aph1cQ9DCZ9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aph1cQ9DCZ9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aph1cQ9DCZ9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms