Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Pop7Q9DCH2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Pop7Q9DCH2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Pop7Q9DCH2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Pop7Q9DCH2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Pop7Q9DCH2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Pop7Q9DCH2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms