Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 1700023C21Rik-201ENSMUST00000143247 389 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Ctcflos-203ENSMUST00000144256 1237 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 4922502N22Rik-201ENSMUST00000204038 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Gm45399-201ENSMUST00000209955 1016 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Gm15225-201ENSMUST00000120449 1017 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Riok3Q9DBU3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms