Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms