Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAA6

Exosc1, Exosome complex component CSL4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc1Q9DAA6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms