Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N5

Cib4, Calcium and integrin-binding family member 4, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib4Q9D9N5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cib4Q9D9N5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms